Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH2Q76I76 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms