Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM5Q71RC9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms