Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MEX3BQ6ZN04 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MEX3BQ6ZN04 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MEX3BQ6ZN04 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MEX3BQ6ZN04 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MEX3BQ6ZN04 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MEX3BQ6ZN04 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MEX3BQ6ZN04 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEX3BQ6ZN04 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms