Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms