Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms