Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms