Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC93Q567U6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms