Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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