Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms