Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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