Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOFQ13790 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOFQ13790 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms