Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms