Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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