Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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