Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE3BQ13370 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
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