Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
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