Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CREMQ03060 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CREMQ03060 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CREMQ03060 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms