Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms