Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms