Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms