Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms