Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP153P49790 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP153P49790 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP153P49790 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP153P49790 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP153P49790 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP153P49790 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP153P49790 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP153P49790 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP153P49790 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms