Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF2P35240 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF2P35240 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NF2P35240 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NF2P35240 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NF2P35240 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NF2P35240 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NF2P35240 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NF2P35240 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF2P35240 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF2P35240 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms