Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPC1P35052 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPC1P35052 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPC1P35052 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPC1P35052 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPC1P35052 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms