Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms