Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms