Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSPP15924 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSPP15924 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms