Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFLP07196 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFLP07196 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFLP07196 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms