Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A1P02462 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A1P02462 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms