Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPAG9O60271 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms