Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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