Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms