Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms