Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms