Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA4Q9UI42 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA4Q9UI42 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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