Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC10Q9NYD6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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