Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR4AQ9NXH8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms