Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A2Q9HAB3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms