Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms