Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAPERQ9BY12 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms