Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms