Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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