Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGF29Q96ES7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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