Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms