Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx4Q91YJ2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms