Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms