Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms