Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FNDC9Q8TBE3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms