Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACBD4Q8NC06 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACBD4Q8NC06 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms