Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q71RC1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q71RC1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q71RC1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q71RC1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q71RC1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q71RC1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q71RC1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms